Giuliano Brace hij besefte al snel dat durfkapitalisten geen grote cheques zouden uitschrijven aan twee oprichters onder de 30 die een volgens hem ’tegendraadse’ benadering nastreven bij het gebruik van kunstmatige intelligentie om nieuwe medicijnen te ontwerpen.
Dus hij maakt de weddenschap zelf.
Na vier jaar aan kunstmatige-intelligentieprojecten bij Amazon te hebben gewerkt, verliet Brace de technologiegigant om zijn visie zelf te financieren. Met behulp van zijn persoonlijke spaargeld en inkomsten uit online handelen investeerde hij een bedrag van zes cijfers Onderzoek naar wortelstokkeneen in Seattle gevestigde startup die op bestelling medicijnachtige kleine moleculen ontwikkelt.
Na de lancering vorig jaar kwam de startup met vijf medewerkers onlangs uit de kast. Naast CEO Brace, die een diploma wiskunde, informatica en economie heeft behaald aan de Universiteit van Albany, omvat het leiderschap van Rhizome:
- Yiwen Wangmede-oprichter en hoofdwetenschapper, die een doctoraat in de scheikunde heeft behaald aan de Carnegie Mellon University.
- Gregorius Sinenkahoofdtechnoloog, gepromoveerd in de natuurkunde en heeft gewerkt bij een Europees onderzoekscentrum en Johnson & Johnson.
- Jan Trotsvoetvoormalig directeur van de afdeling Farmaceutische Chemie van Boehringer Ingelheim, woonachtig in de Verenigde Staten, bekleedt de rol van wetenschappelijk adviseur.
Een andere benadering van het ontdekken van medicijnen
In plaats van te werken met bestaande tools voor het bouwen van moleculen, bouwde Rhizome zijn eigen verfijnde basismodel, genaamd r1. De technologie is een ‘grafisch neuraal netwerk’ en is getraind op meer dan 800 miljoen kleine medicijnachtige moleculen.
De aanpak verschilt van het populaire RoseTTAFold-model van het Institute for Protein Design van de Universiteit van Washington, dat in wezen afhankelijk is van de aminozuren die eiwitten bouwen.
Het r1-model richt zich op de atomen en bindingen waaruit een molecuul bestaat en op de topografie ervan. Dit is waar het grafiekidee om de hoek komt kijken: atomen zijn analoog aan punten in een grafiek, terwijl bindingen vergelijkbaar zijn met de verbindingslijnen ervan.
Het team streeft ernaar om op fragmenten gebaseerde geneesmiddelen te ontdekken, waarbij kleine moleculen worden gecreëerd die zijn geoptimaliseerd om zich te binden aan door de klant gespecificeerde doelen. Zij zullen ervoor zorgen dat elk kandidaat-medicijn efficiënt in het laboratorium kan worden gesynthetiseerd en in aanmerking komt voor patentbescherming.
Rhizoom is vorige week vrijgelaten ADAMSeen geautomatiseerde, open-source AI-tool die natuurlijke taalinstructies gebruikt om de binding van biologische moleculen te simuleren. Het is ook van plan MolSim te delen, een op fysica gebaseerde simulatie die gebruikmaakt van geavanceerde vrije-energieberekeningen die voorspellen hoe sterk een klein molecuul zich aan zijn doelwit zal binden. MolSim zal niet open source zijn.
Visie voor een hub in Seattle
Rhizome heeft onlangs partnerschappen gesloten met natte laboratoria die in staat zijn de prestaties in de praktijk te valideren van potentiële medicijnen die het ontwerpt, en onderzoekt klantrelaties.
De beugel werkt Funderingende in Seattle gevestigde startup-gemeenschap, gelanceerd door ondernemer en investeerder Aviel Ginzburg. De andere medewerkers van Rhizome werken op afstand, maar het plan is om mensen naar Washington te vliegen.
“Ik wil van Seattle echt een soort hub maken voor de ontdekking van kleine moleculen,” zei Brace.
Hij wees op het Allen Institute, het Institute for Protein Design en andere organisaties in de omgeving van Seattle als belangrijke spelers. De regio is ook de thuisbasis van een aantal startups die verband houden met het ontwerpen van geneesmiddelen, waaronder Pauling.AI, Synthetiseer de biografie EN Xaira therapeutischgevestigd in San Francisco en heeft laboratoria in Seattle.
Brace zei dat hij energie krijgt van de mogelijkheid om aan een project te werken dat een aanzienlijke impact op de mensheid zou kunnen hebben, en dat hij er geen spijt van heeft dat hij hiervoor zijn eigen geld ter beschikking heeft gesteld. Hij is over het algemeen optimistisch over het gebruik van kunstmatige intelligentie om moleculen te ontwerpen, zowel voor de gezondheidszorg als voor gebieden als materiaalkunde en geavanceerde productie.
“Dit is de interessantste probleemruimte om in te zitten”, zei Brace.
